截至 2025年，万科公益基金会参与发起了包括深圳壹基金公益基金会(中国第一家民间公募基金会，2010)、深圳市红树林湿地保护基金会(2012)、西藏自治区高山救援基金会(2014年)、深圳市爱佑未来慈善基金会(2015)、大道应对气候变化促进中心(2017)、深圳市一个地球自然基金会(2017)、西安市乡村发展公益慈善基金会(曾用名:西安市绿色乡源环保公益慈善基金会)(2018)、深圳市猛犸公益基金会(2019)、深圳市基金会发展促进会(2019)、山西省开元文物保护基金会(2020)、故宫文物保护基金会等11家基金会和社会服务机构，为这些机构的成立与发展提供了有力支持。2020年5月，为延续万科公益精神，万科去职人员共同发起深圳万行公益基金会，持续关爱和扶持弱势群体、以小爱汇大爱，建设美好生活。十七年间，通过共同努力和合作，这些公益慈善组织得以在灾害救助、儿童关怀、公益人才培养等领域开展更多有意义的项目，推动深圳市及至全国公益事业不断向前发展。